Органный зал филармонии расположен в действующем католическом Храме Преображения Господня. Это любимое место красноярских зрителей, и одна из международных площадок края, известная своим уникальным инструментом чешской фирмы Rieger-Kloss. В органе примерно 2000 труб, 30 регистров и 3 мануала. Главный исполнитель и хранитель Органного зала Андрей Бардин регулярно проводит экскурсии по Храму Преображения Господня, рассказывает об особенностях инструмента и органной музыки, придумывает программы для детей и взрослых, начинающих слушателей и тех, которые уже являются знатоками и ценителями. С момента установки органа в 1983 году на нём играли исполнители из Германии, Латвии, Франции, Швеции. А в рамках фестиваля «Вселенная — орган» в костёле выступают музыканты из Европы, Америки, Японии, ЮАР, словом, со всего мира.